一个水桶找到它们:从一个样本中检测鱼、哺乳动物和鸟类

  • 发布时间:2021-10-12 18:38:59
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在生物多样性丧失加剧的时期,关于物种发生的可靠数据是必不可少的,以便及时和充分地启动保护行动。对于淡水生态系统来说尤其如此,因为淡水生态系统特别脆弱并受到人为影响的威胁。它们的生态状况已被多项国家和国际指令(例如欧洲水框架指令)强调为重中之重。

然而,传统的监测方法,如电捕鱼、诱捕方法或基于观察的评估,这些是鱼类监测的现状,通常既耗时又费钱。因此,在过去十年中,科学家们逐渐同意我们需要一种更全面、更全面的方法来评估淡水生物多样性。

与此同时,最近的研究不断证明,eDNA 元条形码分析(其中在水中发现的 DNA 痕迹用于识别生活在那里的生物)是一种以快速、可靠、非侵入性和相对较低的方式捕获水生生物多样性的有效方法。成本方式。在这种元条形码研究中,科学家对 DNA 进行采样、收集和测序,以便他们可以将其与现有数据库进行比较并识别源生物。

此外,由于 eDNA 元条形码评估使用来自水的样本,通常是位于最低点的溪流,一个这样的样本通常不仅包含与水直接接触的样本的痕迹,例如通过游泳或饮水,还收集了痕迹陆地物种通过降雨、融雪、地下水等间接减少。

在标准的鱼类 eDNA 元条形码评估中,这些“兼捕数据”通常被搁置一旁。然而,从更全面的生物多样性监测的角度来看,它们也具有检测流域中陆生和半陆生物种存在的巨大潜力。

在开放获取学术期刊Metabarcoding and Metagenomics 上报道的新研究中,来自杜伊斯堡-埃森大学和德国环境局的德国研究人员成功检测到数量惊人的萨克森-安哈尔特州本土哺乳动物和鸟类。从沿着穆尔德河的两公里长的河段收集多达 18 升的水。

事实上,由德国联邦环境局资助的 GeDNA 项目的博士生 Till-Hendrik Macher 领导的团队只用了一天时间就收集了样本。使用元条形码分析样本中的 DNA,研究人员确定了该地区多达 50% 的鱼类、22% 的哺乳动物物种和 7.4% 的繁殖鸟类。

然而,该团队还得出结论,虽然通常只需要 10 升水来评估水生和半陆生动物群,陆生物种需要更多的采样。

从越来越多的鱼类 eDNA 元条形码信息中解锁数据可以实现陆地和水生生物多样性监测计划之间的协同作用,进一步增加关于物种时空多样性的重要信息。

“因此,我们鼓励利用鱼类 eDNA 元条形码生物多样性监测数据来为其他保护计划提供信息,”主要作者 Till-Hendrik Macher 说。

“然而,为此目的,eDNA 数据必须共同存储,并可用于州、联邦或国际层面的不同生物多样性监测和生物多样性评估活动,”协调该项目的 Florian Leese 总结道。

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